داستان میراث اگومی در جزیره دورافتاده اگو رخ می‌دهد، جایی که تنها وسیله سرگرمی ساکنان، گوش دادن به صدای زیبای خواننده معروف به «پایان جهان» است. با این حال، ناپدید شدن ناگهانی پایان جهان، جزیره اگو را به گردابی از خشم، اضطراب و شک می‌کشاند، زیرا ساکنان شروع به توطئه و برنامه‌ریزی می‌کنند. در این زمینه، «میراث اگومی» کلید پیدا کردن پایان جهان و پایان دادن به «جنگ بزرگ لیسیدن» را در دست دارد.